High expression of MRPL52 can be used as a prognostic marker of hepatocellular carcinoma and is related to immune infiltration(高表达MRPL52可作为肝癌预后标志物并与免疫浸润相关)
[摘要]目的 通过生物信息学方法分析MRPL52在肝癌中的表达差异及预后价值,探讨MRPL52在肝癌中的预后价值以及免疫调节方面发挥的作用。
方法 采用HCCDB数据库和TIMER数据库分析MRPL52在肝癌组织和癌旁正常组织中表达差异情况,UALCAN数据库分析MRPL52表达水平以及DNA甲基化水平与肿瘤分级、肿瘤分期、是否转移等临床表型的相关性,Kaplan-Meier plotter数据库分析MRPL52表达与肝癌生存的关系,LinkedOmics数据库分析MRPL52共表达基因以及靶点miRNA和转录因子,GENEMANIA数据库构建蛋白互作网络,DiseaseMeth数据库和MEXPRESS数据库分析MRPL52 DNA甲基化水平以及甲基化位点变化情况,TIMER数据库用于分析MRPL52与肝癌免疫浸润的关系。
结果 MRPL52在肝癌中高表达,且与肿瘤分级、肿瘤分期、远端转移等临床表型正相关;高表达的MRPL52与肝癌不良预后相关;共表达分析提示,MRPL52共表达基因富集多个癌症相关信号通路;甲基化分析提示,MRPL52在肝癌中DNA甲基化水平显著降低,此外还发现甲基化位点cg07436208和cg04556361发生显著变化且与MRPL52表达水平负相关,K-M生存分析显示cg04556361甲基化位点与肝癌总生存期负相关;MRPL52与肝癌免疫细胞浸润相关,COX多因素回归分析显示,在没有免疫细胞的情况下,MRPL52能够增加总生存期(overall survival,OS) 的风险1.435倍。
结论
肝癌患者体内MRPL52表达水平升高,且与预后不良密切相关,提示 MRPL52有望成为肝癌预后标志物和治疗的新靶点。
[关键词]肝癌; MRPL52; 预后标志物; 免疫调节