De novo transcriptome sequencing and analysis of genes related to flavonoid metabolism in Abrus cantoniensis Hance（鸡骨草转录组测序及其黄酮类代谢合成相关基因分析）

[摘要]背景  黄酮类化合物是重要的植物代谢产物，不仅能保护植物免受伤害，而且具有多种生物活性。

目的  研究鸡骨草（Abrus cantoniensis，AC）的转录组学特征及其根（AC-R）、茎（AC-S）、成熟叶（AC-ML）和嫩叶（AC-TL）中黄酮类化合物的差异基因。

方法  采用转录组学技术进行研究；通过生物信息学工具进行从头组装测序、基因注释和聚类分析。

结果  有57 325个已组装的Unigene，获得了99.70%以上的clean reads。在Nr、SwissProt、KOG和KEGG数据库中成功注释了36 947个Unigene（64.45%）。在KEGG中，8 269个Unigene被分配到132条代谢途径。差异基因分析表明，AC-R、AC-S、AC-ML和AC-TL不同部位的上调和下调基因存在显著差异，其中AC-R与AC-S组间差异较小。差异基因（DEGs）表达模式聚类分析显示20个基因表达谱的表达趋势不同，其中9个基因表达谱显著富集在类黄酮代谢途径的上游，AC-R、AC-S、AC-ML和AC-TL的苯丙烷生物合成途径的相关基因表达差异最明显。

结论  该结果首次揭示了鸡骨草中黄酮类化合物的转录组信息和差异基因，这证明了目前本实验组正在进行的关于鸡骨草生物合成机制和调控的研究是正确的。

[关键词]鸡骨草； 酶； 类黄酮； mRNA； 转录组