2024年第3期
 
Potential anti-colon cancer agents: Molecular modelling, docking, pharmacokinetics studies and molecular dynamic simulations
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Potential anti-colon cancer agents: Molecular modelling, docking, pharmacokinetics studies and molecular dynamic simulations(潜在的抗克隆癌症药物:分子模型、对接、药代动力学研究和分子动力学模拟)

[摘要目的 使用从文献中获得的实验数据,创建一个可信赖的QSAR模型,将该模型应用于结肠癌癌症的治疗成本低,且几乎无副作用。方法ChemDraw软件创建分子结构,Spartan 14软件对其进行优化并生成量子化学描述符,用特定的软件包进行数据预处理和数据划分。此外,用一些软件工具进行分析和验证,如用Discovery Studio VisualizerPyRx进行分子对接,SwissADM用于药代动力学研究,Desmond用于分子动力学模拟等。结果 开发的QSAR模型预测质量良好,平均绝对误差(MAE)为1.3313,内部验证指标较高(R2=0.9407,调整后的R2=0.9329)。对测试集的外部验证结果良好(R2=0.9012,调整后的R2=0.8436CCC=0.9229)。对接分析确定化合物112111具有-10.4 kj/mol的最低结合亲和力,表明其特定的分子性质。此外,分子动力学(Molecular DynamicMD)模拟提供了对蛋白质-配体复合物的动态行为和相互作用类型的认知,有助于更深入地了解它们的稳定性。结论 模型验证参数证实了模型的可靠性和耐用性。药代动力学研究通过各种参数验证了候选药物的成药性。MD模拟揭示了蛋白质-配体复合物的动态行为和相互作用类型,有助于我们对其稳定性和波动的认识。

[关键词结直肠;对接;Quantitative Structure-Activity Relationship;动态模拟;ADMET;癌症