Tissue-specific comparative transcriptome analysis reveals candidate genes involved in lignans biosynthesis in Saururus chinensis

（组织特异性比较转录组学分析揭示三白草木脂素生物合成候选基因）

[摘要]目的 探究三白草木脂素生物合成的功能基因。方法 采用RNA-Seq技术，对三白草叶和根进行比较转录组学分析，利用最新的生物信息学技术筛选和发现三白草木脂素生物合成候选功能基因，并采用qRT-PCR方法对关键基因的表达进行验证。结果 从头组装的三白草转录组共有 49 430条 Unigenes，其中 33 222 条Unigenes (67.21%) 得到了功能注释。三白草叶和根的比较转录组学分析共筛选出13 031 (26.36%)条差异表达基因。基于GO 和 KEGG 分类及富集分析，结合Swissprot 功能预测，发现27条候选基因，共编码12种介导三白草木脂素生物合成的关键酶。候选基因的qRT-PCR表达测定结果与转录组测序一致。结论 这些结果丰富了我们对木脂素类化合物生物合成相关功能基因的认识，为进一步研究特定木脂素的合成生物学奠定了基础。

[关键词]三白草; RNA-Seq; 比较转录学分析; 木脂素; 功能基因