Pan-cancer Analysis Highlight the Role of PSENEN in the Prognostic and Immunological of Cancer (泛癌分析强调PSENEN在癌症预后和免疫学中的作用)
[摘要]背景 早老素增强子-2(PSENEN,PEN-2)是γ-分泌酶复合体的4种组分之一,据报道在胰腺癌、胃癌和乳腺癌等癌症类型中显著上调。然而,PSENEN在泛癌中的作用尚不清楚。方法 从TGCA数据库和GTEx数据库获得PSENEN在正常和癌症组织中表达的原始数据。通过使用TCGA数据库中的基因表达数据及TIMER2数据库分析PSENEN表达在不同肿瘤中表达的差异。同时,采用Cox回归分析和KM曲线分析PSENEN在泛癌中的预后意义。接着,通过TIMER和XCELL算法分析了PSENEN表达与肿瘤免疫浸润之间的相关性。使用TISDB数据库用于探索人类癌症不同免疫和分子亚型中PSENEN的表达。最后,利用cBioPortal和UALCAN等在线工具对PSENEN的在泛癌中的遗传变异进行了分析。结果 与非肿瘤组织相比,PSENEN在22种人类癌症组织中的表达水平显著上调。其中在7种癌症患者中,PSENEN表达升高表现出较差的总体生存率,有8种癌症患者中较差的疾病特异性生存率与PSENEN表达升高有关。通过使用xCell算法、TIMER算法和Spearman相关分析,发现在多数肿瘤中PSENEN的表达与免疫浸润密切相关,并与免疫检查点相关基因、微卫星不稳定性(MSI)以及肿瘤突变负荷(TMB)有关。另外,我们还发现PSENEN表达与多种人类癌症的不同免疫亚型和分子亚型显著相关。值得注意的是,所有癌症类型中,卵巢上皮性肿瘤的PSENEN突变频率最高。结论 泛癌分析表明,PSENEN可能是一种癌症有效的预后生物标志物,这有助于我们后续深入了解PSENEN在各种恶性肿瘤中的致癌作用。
[关键词]PSENEN; 泛癌分析; 预后; 免疫疗法; 癌症